More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1348 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  67.03 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  67.03 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  66.67 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  66.67 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  66.29 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  66.29 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  65.17 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  64.04 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  64.04 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  64.04 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  67.78 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  67.78 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  67.78 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  67.78 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  63.64 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  60.44 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  60.44 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  60.44 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  65.06 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  63.53 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  63.53 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  55.43 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  65.06 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  55.43 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  55.43 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  55.32 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  51.61 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  59.21 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  65.38 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  64.94 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  57.5 
 
 		 78 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  58.9 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  58.9 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  50.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  48.98 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  48.98 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  41.49 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  46.94 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  46.94 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>