More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3713 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
102 aa  203  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
102 aa  203  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  54.55 
 
 
100 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  54.55 
 
 
100 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  55.56 
 
 
100 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  55.56 
 
 
100 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  54.55 
 
 
100 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  54.55 
 
 
100 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  54.55 
 
 
100 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  54.55 
 
 
100 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  52.53 
 
 
100 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  51 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
122 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  52.33 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  50 
 
 
379 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  48.35 
 
 
99 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  48.35 
 
 
99 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  53.42 
 
 
73 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  43.01 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  54.67 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  47.83 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  45.65 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  46.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  50 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  44.79 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  44.79 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  47.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  40.43 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  40.43 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  40.86 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1708  transposase family  46.15 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>