More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0132 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  73.63 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  73.63 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  70.97 
 
 		 99 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  70.97 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  74.16 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  74.16 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  74.16 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  68.09 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  68.09 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  62.77 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  64.04 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  63.44 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  63.44 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  63.44 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  62.37 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  62.37 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  77.27 
 
 		 75 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  68.83 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  70.13 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  53.33 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  50.56 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  47.83 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  44.57 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  44.57 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  45.92 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  45.26 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  48.31 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  44.57 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  44.57 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  44.57 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>