More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1988 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  95.88 
 
 
106 aa  183  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  40.66 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  40.66 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  38.46 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  40.48 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  40.48 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  36.84 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  36.84 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  36.84 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  36.84 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  36.84 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  36.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  36.67 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  35.56 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  35.79 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  33.33 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  35.79 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  35.56 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  34.44 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  35.23 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  37.36 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  37.36 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
93 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  34.38 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  31.03 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  35.23 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  35.23 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  31.03 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>