More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1166 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  199  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  199  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  199  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  83.67 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  83.67 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  82.65 
 
 		 98 aa  166  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  93.75 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  78.95 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  73.47 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0925  IS3/IS911 family transposase OrfA  77.05 
 
 		 61 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  44.09 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  44.09 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  42.86 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.86 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  41.76 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  41.76 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  37.89 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  37.89 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  39.78 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  39.78 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  40.86 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  40.86 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.57 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  43.43 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  42.57 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  34.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  37.36 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  37.36 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>