More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0280 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  98.91 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  96.74 
 
 		 92 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  97.65 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  95.29 
 
 		 118 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  95.29 
 
 		 118 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  75 
 
 		 92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  69.66 
 
 		 90 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  67.42 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  67.42 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  67.42 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  68.54 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  68.54 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  62.92 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  62.92 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  65.93 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 93 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  60.22 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  60.22 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  60.22 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  69.74 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  54.55 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  54.55 
 
 		 97 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 383 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  58.97 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  84.09 
 
 		 57 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  84.09 
 
 		 57 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  85.37 
 
 		 43 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  43.01 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  48.31 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2733  ISSod1, transposase OrfA  40.91 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>