More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2459 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  100 
 
 		 97 aa  200  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  100 
 
 		 97 aa  200  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 383 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  67.05 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  67.05 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  62.5 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  62.5 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  61.18 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  56.18 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  55.43 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  54.55 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  54.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  54.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  54.12 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  55.56 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  58.44 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  58.23 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  53.52 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  53.52 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  46.25 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  44.57 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2009  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0899439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1929  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2659  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3064  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3190  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4308  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1119  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1728  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1514  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  41.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>