More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00509 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  147  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  147  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  90.41 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  90.41 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  78.08 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  78.08 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  75.34 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  73.97 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  73.97 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  73.97 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  58.33 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  56.94 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  59.72 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  61.19 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  59.72 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  58.9 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  55.22 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  55.22 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  56.06 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  58.9 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  53.52 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  53.52 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  52.11 
 
 		 383 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  58.46 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  51.67 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  46.88 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  43.66 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  42.47 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  40.54 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1213  transposase and inactivated derivative  40.85 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  43.06 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  43.06 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  43.06 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  39.47 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  34.72 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  34.72 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  34.72 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  34.72 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  38.75 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1528  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000359227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>