More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0684 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  68.35 
 
 
78 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
93 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  61.8 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  61.8 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 
90 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  60.67 
 
 
90 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  60.67 
 
 
90 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 
90 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  56.52 
 
 
92 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 
122 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  55.06 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  66.67 
 
 
73 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  66.67 
 
 
73 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  52.81 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  53.41 
 
 
92 aa  91.7  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  62.03 
 
 
84 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  49.43 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  49.43 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  50.59 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  50.59 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  53.26 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 
383 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  40.66 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  40.66 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  40.66 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  40.66 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1514  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4308  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2659  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3190  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>