More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1073 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  51.58 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  52.13 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  51.72 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  39.56 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.39 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.39 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.39 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  38.2 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  38.2 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  47.25 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  41.05 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.94 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.94 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43.01 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  43.01 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  38.2 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  38.2 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  40.23 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  33.68 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  36.7 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  40.66 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  36.7 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>