245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0419 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 78 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  93.51 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  93.51 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  93.51 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  93.51 
 
 		 92 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  64.94 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  63.64 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  63.64 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  64.94 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  63.64 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  61.04 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  61.04 
 
 		 97 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  61.04 
 
 		 97 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  58.44 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  58.44 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 383 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  92.31 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  57.14 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  57.14 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  54.55 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  57.14 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  54.55 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  60.81 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  58.44 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  49.35 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  51.67 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  51.67 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  46.25 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  41.56 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  63.64 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  63.64 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  63.41 
 
 		 43 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  32.93 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  41.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 386 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 386 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  38.16 
 
 		 386 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  38.16 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>