75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4146 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  100 
 
 		 57 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  100 
 
 		 57 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  90.91 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  84.09 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  84.09 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  84.09 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  84.09 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  87.8 
 
 		 43 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  78.57 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  78.57 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  78.57 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  78.57 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  78.57 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  78.57 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  72.73 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  63.64 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  66.67 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  62.79 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  62.79 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  57.78 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  57.78 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  70.73 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  58.14 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0119  transposase IS3/family protein  80 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.41169  normal  0.527236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2844  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000226837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  61.29 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 90 aa  42  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  33.93 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>