More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1672 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 383 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  88.14 
 
 		 255 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  88.14 
 
 		 255 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  60.21 
 
 		 290 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  59.86 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  59.86 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  59.86 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  60.51 
 
 		 277 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  59.11 
 
 		 271 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  59.48 
 
 		 270 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  52.25 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  52.25 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  52.25 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  59.11 
 
 		 270 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  54.96 
 
 		 283 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  54.96 
 
 		 283 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  59.11 
 
 		 269 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  55.12 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  55.12 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  55.12 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  56.04 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  52.84 
 
 		 283 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  55.02 
 
 		 272 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  53.62 
 
 		 279 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  53.26 
 
 		 279 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00510  ISxac3 transposase  55.39 
 
 		 272 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  59.57 
 
 		 231 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  52.83 
 
 		 259 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  53.96 
 
 		 267 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  53.96 
 
 		 267 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  56.02 
 
 		 269 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  52.08 
 
 		 250 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  58.05 
 
 		 252 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  62.36 
 
 		 180 aa  252  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 280 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  44.81 
 
 		 280 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  45.39 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  49.79 
 
 		 239 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 		 280 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 		 289 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  62.96 
 
 		 167 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 		 289 aa  234  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.3 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  41.84 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  33.78 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  34.14 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  33.51 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  33.51 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  33.51 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  33.51 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  33.51 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 286 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 286 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 286 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.81 
 
 		 286 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  38.16 
 
 		 286 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.81 
 
 		 286 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.81 
 
 		 286 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.81 
 
 		 286 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.81 
 
 		 286 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>