More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0361 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  97.87 
 
 
94 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  97.87 
 
 
94 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  97.87 
 
 
94 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 
94 aa  168  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 
96 aa  166  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  53.76 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  54.95 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  54.95 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  52.75 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  50 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  52.75 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2843  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 
92 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 
92 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 
92 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
97 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 
97 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 
92 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  51.06 
 
 
92 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  47.87 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
118 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  48.84 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  48.84 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  53.76 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  47.83 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  47.83 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  49.4 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 
383 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  48.65 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  48.65 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  51.85 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  38.89 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  40.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  40.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  40.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  40.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  40.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  41.84 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  40.91 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>