More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5456 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  91.11 
 
 		 90 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 97 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 97 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 90 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  81.11 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  81.11 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  69.66 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  68.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  71.11 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  71.11 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  71.11 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  67.05 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  67.05 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  78.08 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  78.08 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  69.66 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  66.29 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 383 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  59.78 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  66.27 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  66.27 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  65.48 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  67.53 
 
 		 84 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  63.64 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  65.82 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 78 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  70 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  45.35 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  44.79 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  78.57 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  78.57 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1133  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1464  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4184  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4301  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4441  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2009  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0899439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2659  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1929  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3064  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>