121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2843 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2843  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 
96 aa  91.7  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
94 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  38.3 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  38.3 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  37.08 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  37.89 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  37.89 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  34.83 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  36.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  36.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  36.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  40.66 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  36.14 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  36.14 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  31.96 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  34.52 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  34.52 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 
383 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  32.58 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  32.58 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  35.56 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  29.59 
 
 
110 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.12 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>