More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1328 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  94.85 
 
 
122 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  97.78 
 
 
100 aa  175  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  97.78 
 
 
91 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  97.75 
 
 
100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  97.75 
 
 
100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.85 
 
 
100 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  98.85 
 
 
102 aa  169  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  97.7 
 
 
100 aa  167  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  97.7 
 
 
100 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  97.7 
 
 
100 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  97.7 
 
 
100 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  97.7 
 
 
100 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  95.51 
 
 
379 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  91.95 
 
 
100 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  91.95 
 
 
100 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1708  transposase family  97.47 
 
 
87 aa  150  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0020  transposase family  88.46 
 
 
81 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  96.77 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  47.06 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0196  transposase family  75.51 
 
 
49 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  38.04 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  38.04 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.16 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.16 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.16 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  42.17 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  49.15 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1363  transposase family  96.55 
 
 
45 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  43.33 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  43.33 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  36.9 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  38.82 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  34.09 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  36.14 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>