More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3328 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  193  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  193  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  82.47 
 
 
97 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  69.15 
 
 
96 aa  140  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  71.28 
 
 
96 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  71.26 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  69.88 
 
 
96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  44.79 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  50.54 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  42.71 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  42.71 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  42.71 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  50 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  50 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  48.96 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
101 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  43.75 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  43.3 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  43.3 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0623  hypothetical protein  43.3 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  45.74 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  45.26 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  45.26 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  48.94 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  47 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  47 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  38.95 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  38.95 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  38.95 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  38.95 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  38.95 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  43.88 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  37.89 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  44.9 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  30.85 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  35.79 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  43.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>