More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0282 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  100 
 
 
120 aa  236  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  100 
 
 
110 aa  216  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  83.64 
 
 
110 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  83.64 
 
 
110 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  83.64 
 
 
110 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  70.37 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  65 
 
 
101 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  57.84 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  57.84 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  62.37 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  53.54 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  52.08 
 
 
99 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  52.08 
 
 
99 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  45.16 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  47 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  42.27 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  51.61 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  51.61 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  51.61 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  51.61 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  45.28 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  45 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  45 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  45 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  43.01 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  44.34 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.34 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  49.38 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  44.34 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  44.33 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  45.37 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  45.37 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  39.39 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  39.39 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  42.45 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  39.39 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  47.31 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  46.24 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>