More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0546 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 
101 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  54.95 
 
 
98 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  43.82 
 
 
293 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  45.92 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  43.3 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  43.3 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  43.3 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  43.96 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1290  ISCps2, transposase orfA  41.3 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  41.3 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  41.3 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  39.18 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  41.05 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  41.38 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  42.17 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  39.58 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  39.58 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2585  transposase IS3/IS911  44.29 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  41.05 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  35.56 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  35.56 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  39.56 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  35.56 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  35.56 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  41.24 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  40.23 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.84 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  39.6 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  39.6 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>