More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1560 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  95.74 
 
 
94 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
98 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  43.96 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  44.09 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  43.01 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  43.01 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  43.01 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  42.68 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  41.94 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  37.36 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
98 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  40.66 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  39.33 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  42.39 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  42.39 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  33.71 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  32.58 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  38.2 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  40.22 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>