More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4216 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
105 aa  216  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
105 aa  216  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  99.05 
 
 
105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  76.19 
 
 
105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 
98 aa  95.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 
98 aa  95.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  46.39 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  46.39 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  50.52 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  45.74 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  45.74 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  45.74 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  38.3 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  41.05 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  41.67 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  36.46 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  36.46 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0398  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  32.63 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0287  transposase  37.23 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  34.31 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1243  ISSdy1, transposase OrfA  35.35 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000354478  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  35.05 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.11 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.11 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  35.11 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0601  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0629  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  31.82 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2585  transposase IS3/IS911  38.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  34.44 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  36 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1228  ISSdy1, transposase OrfA  34.34 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000245829  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  32.61 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>