More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2162 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  95.83 
 
 
96 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  95.83 
 
 
96 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  95.83 
 
 
96 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
96 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  80.65 
 
 
282 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2844  transposase IS3/IS911 family protein  78.18 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000226837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  38.3 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  35.79 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.94 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.94 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  40.62 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  41.05 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  41.05 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  38.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0424  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1050  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3020  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  40.86 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  40.86 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3190  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>