More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0235 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  62.14 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  62.14 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  62.14 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  48.54 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  48.54 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  48.54 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  49 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  50.5 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  47.52 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  47.52 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  46.53 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  46.53 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  46.53 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  49.47 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  45.54 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  43.69 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  46.08 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  45.83 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  44.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  44.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  44.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  44.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  44.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  45.63 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  43.75 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  44.66 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  44.66 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  44.66 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  44.66 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  44.66 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  45.63 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  44.66 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  43.69 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  42.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  42.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  41 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  38.71 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  38.71 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  38.71 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  40 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>