More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3829 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  69.31 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  71 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  71 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  71 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  71 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  71 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  61.39 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  61.39 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  61.39 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  61.39 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  61.39 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  61.39 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  60.78 
 
 		 104 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  65 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  65.66 
 
 		 103 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  68.42 
 
 		 100 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  64.36 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  129  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  67.37 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  64.36 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  60.78 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  62.24 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  66.32 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  66.67 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  58.82 
 
 		 102 aa  120  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  59.8 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  60.64 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  59.8 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>