More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2278 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  85.39 
 
 		 96 aa  159  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  77.65 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  70.79 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  73.56 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  71.26 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  71.26 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  43.02 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  43.02 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  43.02 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  43.68 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  43.68 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.26 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  41.38 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  41.38 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  41.38 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  35.16 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04145  IS911 protein  36.36 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  34.41 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04109  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  34.04 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  34.07 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  30.34 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  41.86 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  41.86 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  43.33 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  43.33 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  33.33 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  37.08 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  38.82 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  38.82 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  37.08 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  37.08 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>