More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1182 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  205  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  67.82 
 
 
97 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  67.82 
 
 
97 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  67.82 
 
 
97 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
97 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  46.43 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.53 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.53 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.53 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  43.02 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  41.76 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  44.71 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  40.45 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  41.86 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  39.18 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  43.02 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  43.02 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  41.94 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  40.96 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  39.13 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  40 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  40 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  41.18 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  38.1 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
392 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
392 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  41.86 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  41.86 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  41.86 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  41.86 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  41.86 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
386 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43.02 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  42.35 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0623  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>