More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0012 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0084  putative transposase, truncation  96.77 
 
 
62 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.757347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  47.31 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  47.31 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  47.31 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  53.26 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  51.06 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  52.17 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  44.55 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  45.65 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  47.37 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  47.37 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  47.37 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  47.37 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  47.37 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  44.68 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  44.68 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  44.68 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  48.91 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  46.74 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  45.26 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  43.48 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
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