More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3405 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 94 aa  190  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 94 aa  190  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 94 aa  190  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  97.87 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 		 94 aa  168  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 96 aa  166  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  53.76 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  56.52 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  56.52 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  48.94 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  52.75 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  52.75 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2843  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  47.87 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  50 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  51.58 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  51.58 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  51.58 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  51.58 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 		 91 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 		 91 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  54.84 
 
 		 91 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  47.67 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  47.67 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  47.67 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  48.86 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  48.86 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  57.32 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  48.19 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 383 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  51.85 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  48.65 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  48.65 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  39.77 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  42.05 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.05 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.77 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  41.84 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>