138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3919 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 90 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  56.1 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  56.1 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  51.22 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  51.22 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  48.78 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  48.15 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  58.46 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  58.46 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  45.12 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  44.58 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  43.9 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  43.9 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  43.9 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  42.68 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  48.57 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  42.86 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  42.86 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  40.24 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  41.56 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  35.48 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  35.8 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0621  hypothetical protein  50.75 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.88144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  30.49 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  30.49 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  36.84 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  36.84 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  36.84 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  30.49 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  36.47 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  35.8 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C58  transposase  37.33 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  27.71 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  37.68 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  30.49 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1213  transposase  37.33 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.474133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>