More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02980 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  81.11 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  81.11 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  81.11 
 
 		 90 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 97 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 97 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 90 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  66.67 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  61.36 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  62.5 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  62.5 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  60.87 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  60.71 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  60.24 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  60.24 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  60.67 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 		 383 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  59.52 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  52.75 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  58.44 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  49.45 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  44 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  43.82 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  44.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  38.2 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  43.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>