More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2547 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  100 
 
 
100 aa  196  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  46 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  50.55 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  50.55 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  49.45 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  49.45 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  48.31 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  48.35 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  46.94 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  46.94 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  50 
 
 
101 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  44.9 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  46.15 
 
 
100 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  45.26 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  49.45 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  49.45 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  46.15 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  47.13 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  43.62 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  47.06 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  44.33 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  44.33 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  44.33 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  40.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  43.82 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  43.82 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  51.43 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.53 
 
 
379 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  36.26 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>