More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6988 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  82.42 
 
 
98 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  68.13 
 
 
98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3100  hypothetical protein  86.96 
 
 
71 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  51.72 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  51.72 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  51.72 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  51.72 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2996  hypothetical protein  82.93 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  38.46 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.62 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.62 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  43.62 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  36.26 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  40.7 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1495  transposase  34.88 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  40.78 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  40.18 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  34.74 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1130  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2733  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3397  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  35.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0623  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>