More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02982 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  100 
 
 
97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  53.26 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  50.52 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  46 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  51.09 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  51.09 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  48.91 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  48.91 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  51.09 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  51.09 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  43.01 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  44.79 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  41.57 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.22 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  45.65 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  41.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  41.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  41.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  41.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  39.13 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.13 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  39.8 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  40.22 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.13 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  39.13 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  39.13 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  39.13 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.8 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  37.78 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  44.94 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  44.94 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  39.8 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  39.36 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>