More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04150 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  100 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  97 
 
 
100 aa  191  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  97 
 
 
100 aa  191  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  96 
 
 
100 aa  189  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  95 
 
 
100 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  95 
 
 
100 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  95 
 
 
100 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  95 
 
 
100 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  95 
 
 
100 aa  186  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  90 
 
 
100 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
122 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  89 
 
 
100 aa  177  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  97.78 
 
 
113 aa  175  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  91.67 
 
 
102 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  94.38 
 
 
379 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1708  transposase family  96.2 
 
 
87 aa  150  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  94.67 
 
 
78 aa  140  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0020  transposase family  87.18 
 
 
81 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1363  transposase family  92.86 
 
 
45 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  48.35 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4658  transposase family  92.68 
 
 
41 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.68093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  50.7 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  40.43 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0196  transposase family  73.47 
 
 
49 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  43.43 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  43.43 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  39.8 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  41.76 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.01 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.01 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.01 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  42.45 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  42.45 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
99 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
99 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  40.4 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  40 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  40.4 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>