More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3069 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
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NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3044  transposase IS3/IS911 family protein  70.83 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_2153  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1067  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.285311 
 
 
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NC_009077  Mjls_1615  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146541  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2242  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.021715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2370  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.695527 
 
 
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NC_009077  Mjls_2864  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0575  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3689  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5496  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.30251 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  47.42 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  40.82 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  40.82 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  40.82 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3725  transposase IS3/IS911 family protein  50.63 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344473  normal  0.403517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  40.43 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  41.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  40.43 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  36.84 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  37.63 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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