More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1796 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  56.6 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  56.6 
 
 
107 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  55.66 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  50 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  50 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  50 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  55.66 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  55.66 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  57.94 
 
 
109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  57.94 
 
 
109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  57 
 
 
108 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  50 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  53.15 
 
 
109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  51.46 
 
 
108 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  53.27 
 
 
108 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  53.27 
 
 
108 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
107 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  54.37 
 
 
109 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  49.06 
 
 
108 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  51.92 
 
 
107 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  51.92 
 
 
107 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  49.51 
 
 
108 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  48.51 
 
 
102 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  50.49 
 
 
108 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  48.54 
 
 
108 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  50 
 
 
112 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  50 
 
 
112 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  50.96 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  51.43 
 
 
107 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  51.43 
 
 
107 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  51.43 
 
 
107 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
107 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  51.43 
 
 
107 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  50 
 
 
107 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
108 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
108 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
108 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 
108 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  48.11 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  48.57 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  47.2 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  47.12 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  50 
 
 
492 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  46.99 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  42.31 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>