More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7044 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
98 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3725  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344473  normal  0.403517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  55.77 
 
 
106 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  51.69 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  44.21 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  46.24 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  46.24 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1973  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2153  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.46 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.46 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.46 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  41.24 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  39.58 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1320  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  43.18 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  43.18 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  43.18 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  38.38 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  39.33 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>