96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0020 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0020  transposase family  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  97.44 
 
 		 100 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  97.44 
 
 		 100 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  88.46 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  88.46 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  88.46 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  88.46 
 
 		 100 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1708  transposase family  88.46 
 
 		 87 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  88.46 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  88.46 
 
 		 379 aa  140  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  87.18 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  87.18 
 
 		 91 aa  140  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  87.18 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  87.18 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  87.18 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  87.18 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  85.9 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  84.91 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0196  transposase family  83.67 
 
 		 49 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.47 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  45.1 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  41.43 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  43.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  43.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  34.21 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.65 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.65 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.65 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  43.75 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  38.57 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.89 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.89 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  39.22 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  37.18 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  40.82 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  39.22 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1090  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1691  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1954  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3660  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3719  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3739  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5059  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  30.43 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 		 92 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 		 92 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 		 92 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  31.88 
 
 		 92 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>