131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1708 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1708  transposase family  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  100 
 
 		 100 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  100 
 
 		 100 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  100 
 
 		 100 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  100 
 
 		 100 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  98.73 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.73 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  97.47 
 
 		 100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  96.2 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  97.47 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  97.47 
 
 		 379 aa  151  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  96.2 
 
 		 91 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  96.2 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  91.14 
 
 		 100 aa  148  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  91.14 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0020  transposase family  88.46 
 
 		 81 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2600  transposase family  96.3 
 
 		 78 aa  103  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0196  transposase family  75.51 
 
 		 49 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  45.71 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.24 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  36.23 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  36.23 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  36.23 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  36.23 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  46 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  36.49 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  35.8 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  35.8 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  36.25 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  41.18 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  41.18 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  36.25 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  32.89 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  38 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  33.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  38.27 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  42.03 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  42.03 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3660  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3719  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3739  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5059  transposase IS3/IS911 family protein  34.52 
 
 		 105 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2864  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0575  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3689  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5496  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.30251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 98 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 98 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>