More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1477 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 		 99 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  61.86 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  62.89 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  60 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  60 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0925  IS3/IS911 family transposase OrfA  65 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  44.33 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  46.46 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  47.42 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  46.39 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  46.39 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  46.39 
 
 		 100 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04150  IS600 ORF1-like protein  45.36 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  42 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  42 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04113  hypothetical protein  45.26 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  39 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3716  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  40.82 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  40.82 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  39.58 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  38.14 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  41.75 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1328  transposase family protein  45.05 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  38.95 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  37.5 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  37.5 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  37.5 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  39.58 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  38.61 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  38.64 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  35.63 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  38.64 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  35.63 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>