More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  98.99 
 
 
99 aa  197  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  96.97 
 
 
99 aa  192  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  95.96 
 
 
99 aa  191  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  94.95 
 
 
99 aa  189  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  94.95 
 
 
99 aa  189  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  78.26 
 
 
100 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 
95 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 
95 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 
95 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4463  transposase IS3/IS911 family protein  70.65 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0130  transposase IS3/IS911 family protein  70.65 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3498  transposase IS3/IS911 family protein  70.65 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000201546  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  70.65 
 
 
95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06580  Transposase  69.57 
 
 
95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0602807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 
94 aa  133  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17910  Transposase  66.34 
 
 
101 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.252162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10240  Transposase  65.96 
 
 
97 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3194  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0960855  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3350  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1933  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00315482  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0231  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3954  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0377  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2705  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.217344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0385  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2596  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1439  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0436436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1486  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.089931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0255  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0276  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1003  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1430  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0301  transposase IS3/IS911 family protein  61.7 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3486  transposase IS3/IS911 family protein  60.64 
 
 
100 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05320  Transposase  68.09 
 
 
102 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4507  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 
93 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0616  transposase IS3/IS911 family protein  64.89 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3241  transposase IS3/IS911 family protein  63.83 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.680092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3191  transposase IS3/IS911 family protein  63.83 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3210  transposase IS3/IS911 family protein  55.91 
 
 
98 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1095  transposase IS3/IS911 family protein  63.83 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5960  transposase IS3/IS911 family protein  63.83 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3179  transposase IS3/IS911  62.77 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5590  transposase IS3/IS911  62.77 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302178  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5991  transposase IS3/IS911 family protein  62.77 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  48.91 
 
 
95 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 
95 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  51.61 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  39.77 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  47.89 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  50.72 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  50.72 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5969  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  36.56 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  43.66 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  43.66 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  46.38 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  46.38 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  43.66 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  43.06 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  37.86 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  34.83 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1973  transposase IS3/IS911 family protein  38.27 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  39.51 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  38.03 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  38.03 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  39.06 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  39.06 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>