More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3370 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
98 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  66.33 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  68.13 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  52.13 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  52.13 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  52.13 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  52.13 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3100  hypothetical protein  59.65 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  38.78 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1232  hypothetical protein  39.58 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  39.58 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  39 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  39.13 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  38.95 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  37.11 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0623  hypothetical protein  38.89 
 
 
95 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  40.57 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  34.31 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  34.31 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  34.31 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  32.26 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  36.56 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2996  hypothetical protein  63.41 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1130  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2733  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3397  ISSod1, transposase OrfA  34.74 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1929  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>