More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2571 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 		 108 aa  197  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2538  transposase IS3/IS911 family protein  75.47 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  49.51 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  48.54 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.16 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  41 
 
 		 93 aa  66.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  41 
 
 		 93 aa  66.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  41 
 
 		 93 aa  66.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  41 
 
 		 93 aa  66.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  40.21 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  38.61 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.62 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.62 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.62 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  38.61 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  41.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  35.92 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  39.25 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  38.61 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0872  transposase IS3/IS911 family protein  33.98 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.356315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0866  transposase IS3/IS911 family protein  33.98 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1883  transposase IS3/IS911 family protein  33.98 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  33.96 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  33.96 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  39.22 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  39.22 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  32.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  32.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  33.98 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  35.24 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  39.62 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  33.98 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  33.98 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  33.98 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  33.98 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  35.85 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  35.85 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  35.85 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>