More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1861 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 98 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  82.02 
 
 		 107 aa  147  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  44.55 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1973  transposase IS3/IS911 family protein  43.37 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2438  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  45.65 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1320  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  38.61 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  38.61 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0678  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  39.8 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  42.16 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21100  Transposase  37.63 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20150  Transposase  37.63 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101753  normal  0.0248852 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  37.76 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  37.76 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  37.76 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  37.76 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  37.76 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  40.2 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  40.2 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  40.2 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23530  Transposase  37.63 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23460  Transposase  36.56 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.519967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18710  Transposase  36.56 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  41 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  45.45 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  45.45 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  39.39 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  39.39 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  45.45 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  45.45 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  39.39 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  37.76 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  37.76 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17770  Transposase  35.48 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.894128  normal  0.461539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3646  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3633  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  41.77 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1241  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0276209  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2874  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119781  normal  0.0116758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0629  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2065  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000072844  hitchhiker  0.00973796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13980  Transposase  36.08 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  36.36 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  43.82 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>