More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1916 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 
108 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 
108 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 
108 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 
108 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  93.46 
 
 
108 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2538  transposase IS3/IS911 family protein  76.19 
 
 
108 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  41.18 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  41.18 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  41.18 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  42.42 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  42.42 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  42.42 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  42.42 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  38.24 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.26 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.26 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.26 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  38.1 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.08 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  39.05 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  35.92 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  36.27 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0872  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.356315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1883  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0866  transposase IS3/IS911 family protein  34.95 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  32.38 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  32.38 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  32.38 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  32.38 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  38.24 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  39 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  35.64 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  33.94 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  32.67 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  37.62 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  37.62 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  35.14 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  35.14 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  38.61 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  35.14 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  35.14 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>