36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3100 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  79.63 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  86.96 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2996  hypothetical protein  92.68 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  59.65 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3771  hypothetical protein  82.35 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  48.89 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  58.54 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  58.54 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  58.54 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  58.54 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2538  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  32.69 
 
 		 103 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2100  transposase IS3/IS911  42.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  42.86 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  40 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  44.44 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2844  transposase IS3/IS911 family protein  37.7 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000226837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  35.56 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1373  transposase IS3/IS911 family protein  36.21 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  37.88 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>