99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3643 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3643  transposase  100 
 
 		 75 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  77.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  63.49 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  63.49 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  53.03 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  59.09 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  59.38 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  59.38 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  57.81 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  52.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  53.12 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  49.25 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  53.12 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  53.12 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  53.12 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  49.25 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  49.25 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  47.76 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  47.76 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  52.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  52.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  47.06 
 
 		 98 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  47.06 
 
 		 98 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  57.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  57.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  48.89 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  48.98 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  39.71 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  39.71 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  39.71 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  44.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  44.26 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  40 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  35.62 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  39.71 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2631  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 75 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  44.26 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>