More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1213 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1213  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
83 aa  173  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  38.16 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  40.54 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0424  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1050  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3020  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  42.47 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  40.85 
 
 
383 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0375  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1080  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1082  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1130  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1133  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1464  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1514  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2463  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2733  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3397  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3569  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3607  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3609  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4184  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4278  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4293  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4301  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4441  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4308  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3190  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2009  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0899439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1119  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1929  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3064  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2659  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1728  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  38.03 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  38.03 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  43.84 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  43.84 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  43.66 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  43.66 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  43.66 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0471  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
104 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  40.85 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  40.85 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  40.28 
 
 
90 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  39.24 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  37.84 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>