More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1398 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  100 
 
 
101 aa  203  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  100 
 
 
101 aa  203  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2873  transposase-like  93.75 
 
 
48 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  48.91 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  48.45 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  46.39 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  46.39 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  46.39 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  46.46 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  47 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  47 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  47 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  41.67 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  37.08 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  41.84 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  39.58 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  39.58 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  39.58 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  37.76 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3778  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 
386 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  40.7 
 
 
357 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  37.23 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  40.7 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  39 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  39 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  39.53 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  39 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  39 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  39 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3685  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0532244  normal  0.0505039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  39.8 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2991  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  37.5 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  35.29 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  35.29 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  37.76 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  38.78 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  38.78 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  37.89 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>